ここはジャパリパーク。
サンドスターの不思議な力で生まれたフレンズたちは、姿かたちは違ってもみんな仲良しです。
今は、サバンナのフレンズが中心となって『ジャパリアカデミー』を作ろうとしていました。
パークの謎を解き明かしていくという新しい『しせつ』の誕生に、みんなワクワク。
ところが、最近現れた空のフレンズたちが、「私たちがパークを仕切る！」と宣言。
なんと陸のフレンズと空のフレンズが、リーダーの座を巡って対立することに…！
不穏な空気を察知した新入りのオオミミギツネは、「パフォーマンス対決で決めよう」と提案します。

同じ頃、パーク内には様々な不具合が生じていました。
かつて『ヒト』が作った『おひさまシステム』に障害が出ていたのです。
新しいエネルギーを生み出すには、山の上にある、止まったままの風車を動かすしかありません。
対立が続くフレンズたちは、力を合わせてパークを守ることができるのでしょうか…？